AMPLIFIKASI GEN N-METHYLTRANSFERASE KOPI ROBUSTA DI PERKEBUNAN KOPI RAKYAT WIYONO LAMPUNG
AMPLIFIKASI GEN N-METHYLTRANSFERASE KOPI ROBUSTA DI PERKEBUNAN KOPI RAKYAT WIYONO LAMPUNG
DOI:
https://doi.org/10.30605/biogenerasi.v10i2.5544Keywords:
Kopi robusta, Pesawaran, n-methyltransferase, polymerase chain reactionAbstract
Kopi robusta (Coffea canephora) merupakan salah satu tanaman perkebunan yang umum ditanam di Indonesia karena memiliki nilai ekonomis tinggi. Kabupaten Pesawaran menjadi salah satu daerah di Lampung yang banyak mengusahatanikan kopi robusta dalam skala perkebunan rakyat. Isolasi dan amplifikasi gen menjadi langkah awal dalam analisis molekuler untuk mengetahui keragaman gen pada kopi robusta. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hasil isolasi dan amplifikasi DNA daun kopi robusta dari perkebunan kopi rakyat Pesawaran, Lampung. Isolasi DNA dari 5 sampel daun kopi robusta telah dilakukan mengacu pada protokol kit isolasi DNA dari Geneaid Genomic DNA Mini Kit (Plant). Hasil ekstraksi kemudian diamplifikasi menggunakan primer N-methyltransferase dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Visualisasi hasil ekstraksi dan amplifikasi dilakukan menggunakan elektroforesis gel agarosa 1%. Visualisasi atas hasil ekstraksi telah menunjukkan diperolehnya ekstrak DNA yang baik. Visualisasi atas hasil amplifikasi menunjukkan telah diperolehnya fragmen DNA sepanjang 600bp.
Downloads
Download data is not yet available.
References
Aprilianingsih, R., Wahidah, B. F., dan Hariri, M. R. 2021. Optimasi Suhu Annealing Marka ISSR Sebagai Langkah Awal Dalam Pengejawantahan Keragaman Genetik Ficus fistulosa dan Ficus variegata. In Gunung Djati Conference Series, 6(11): 141-147.
Badan Pusat Statistik. 2023. Statistik Kopi Indonesia. Statistics Indonesia. 7 (1) 2714-8505. Emilia, E., dan Anhar, A. (2021). Optimalisasi Metode Ekstraksi DNA Daun, Kulit Kayu dan Kayu Pinus merkusii. Jurnal Ilmiah Mahasiswa Pertanian, 6(4), 766-778.
Eskani, I. N., Mandegani, G. B., Utamaningrat, I. M. A., dan Sucahyono, A. E. 2020. Pengawetan Kayu Karet (Havea brasiliensis) dan Kayu Kopi (Coffea sp.) dengan Brotowali (Tinospora crispa). Dinamika Kerajinan dan Batik: Majalah Ilmiah, 37(2), 185-194.
Muhammad, F. (2024). Aplikasi Molekuler Dan Analisis Genetik Spesies Kopi Robusta (Coffea canephora Pierre Ex A. Froehner) Pada Kth Mandiri Jaya, Gapoktanhut Lestari Sejahtera, Kabupaten Tanggamus. Skripsi. Universitas Lampung.
Khairani, M., Balqis, P., Izza, Y. U., Mutiara, N., dan Rifda. R. 2024. Analisis Jurnal Variasi Genetik Makhluk Hidup Eukariotik. Jurnal Multidisiplin Ilmu Akademik, 1(3), 861-871.
Mahadi, I., dan Anggraini, M. 2021. Using Alternative Buffer for DNA Genomic Isolation In Forest Trees. Jurnal Penelitian Kehutanan Wallacea, 10(2), 117-130. Maryam, S., Nuryanti, S., dan Rahbuddin, K. E. F. 2022. Karakterisasi Makroskopik dan Mikroskopik Serta Isolasi DNA Isolat Fungi Endofit Daun Ekor Naga (Rhaphidophora pinnata LF Schott). As-Syifaa J Farm, 14, 139-147.
Mawardi, A., dan Simonapendi, M. L. 2016. Uji Efektivitas Metode Isolasi DNA Genom Kopi Arabika (Coffea arabica L.) asal Kabupaten Jayawijaya. Jurnal Biologi Papua, 8(1), 7-12.
Merdekawati, F., dan Nurhayati, B. 2023. Desain Primer Gen Pengkode RNA Dependent RNA Polimerase (RdRp) untuk Deteksi Sars Cov2 dengan menggunakan Real Time Polymerase Chain Reaction. Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung, 15(1), 30-36.
Raharimalala, N., Rombauts, S., McCarthy, A., Garavito, A., OrozcoArias, S., Bellanger, L., dan Crouzillat, D. 2021. The Absence Of The Caffeine Synthase Gene Is Involved In The Naturally Decaffeinated Status Of Coffea humblotiana, A Wild Species From Comoro Archipelago. Scientific Reports, 11(1), 1-14.
Rahmawati, N. D., dan Iftitah, S. N. 2024. The Effect Of Concentration And Soaking Length Of Aloe Vera Gel On The Growth Of Robusta Coffee (Coffea canephora) Cuttings. Agrisaintifika: Jurnal Ilmu-Ilmu Pertanian, 8(2), 286-291.
Sadikin dan Muhammad I. 2021. Optimasi Protokol Ekstraksi DNA Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq.) pada Umur Tanaman yang Berbeda: Review." Agrista: Jurnal Ilmiah Mahasiswa Agribisnis UNS, 5(1): 1379-1389.
Saraswati H, Seprianto S, dan Wahyuni F D. 2019. Desain Primer Secara In Silico untuk Amplifikasi Gen cryIII dari Bacillus thuringiensis Isolat Lokal. Indonesian Journal of Biotechnology and Biodiversity,3(1), 33-38.
Sari, V. K., dan Restanto, D. P. 2022. Review Artikel: Metode Ekstraksi DNA Genom untuk Tanaman Tinggi Kandungan Polisakarida dan Metabolit Sekunder. Agroteknika, 5(2), 118-129
Sembiring, E. R., Terryana, R. T., Anggraheni, Y. G. D., Prihaningsih, A., Batubara, I., Nurcholis, W.,dan Harmoko, R. Efektivitas Metode Ekstraksi DNA pada Daun Segar dan Kering dari Tanaman Obat. Vegetalika, 12(3), 211-227.
Badan Pusat Statistik. 2023. Statistik Kopi Indonesia. Statistics Indonesia. 7 (1) 2714-8505. Emilia, E., dan Anhar, A. (2021). Optimalisasi Metode Ekstraksi DNA Daun, Kulit Kayu dan Kayu Pinus merkusii. Jurnal Ilmiah Mahasiswa Pertanian, 6(4), 766-778.
Eskani, I. N., Mandegani, G. B., Utamaningrat, I. M. A., dan Sucahyono, A. E. 2020. Pengawetan Kayu Karet (Havea brasiliensis) dan Kayu Kopi (Coffea sp.) dengan Brotowali (Tinospora crispa). Dinamika Kerajinan dan Batik: Majalah Ilmiah, 37(2), 185-194.
Muhammad, F. (2024). Aplikasi Molekuler Dan Analisis Genetik Spesies Kopi Robusta (Coffea canephora Pierre Ex A. Froehner) Pada Kth Mandiri Jaya, Gapoktanhut Lestari Sejahtera, Kabupaten Tanggamus. Skripsi. Universitas Lampung.
Khairani, M., Balqis, P., Izza, Y. U., Mutiara, N., dan Rifda. R. 2024. Analisis Jurnal Variasi Genetik Makhluk Hidup Eukariotik. Jurnal Multidisiplin Ilmu Akademik, 1(3), 861-871.
Mahadi, I., dan Anggraini, M. 2021. Using Alternative Buffer for DNA Genomic Isolation In Forest Trees. Jurnal Penelitian Kehutanan Wallacea, 10(2), 117-130. Maryam, S., Nuryanti, S., dan Rahbuddin, K. E. F. 2022. Karakterisasi Makroskopik dan Mikroskopik Serta Isolasi DNA Isolat Fungi Endofit Daun Ekor Naga (Rhaphidophora pinnata LF Schott). As-Syifaa J Farm, 14, 139-147.
Mawardi, A., dan Simonapendi, M. L. 2016. Uji Efektivitas Metode Isolasi DNA Genom Kopi Arabika (Coffea arabica L.) asal Kabupaten Jayawijaya. Jurnal Biologi Papua, 8(1), 7-12.
Merdekawati, F., dan Nurhayati, B. 2023. Desain Primer Gen Pengkode RNA Dependent RNA Polimerase (RdRp) untuk Deteksi Sars Cov2 dengan menggunakan Real Time Polymerase Chain Reaction. Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung, 15(1), 30-36.
Raharimalala, N., Rombauts, S., McCarthy, A., Garavito, A., OrozcoArias, S., Bellanger, L., dan Crouzillat, D. 2021. The Absence Of The Caffeine Synthase Gene Is Involved In The Naturally Decaffeinated Status Of Coffea humblotiana, A Wild Species From Comoro Archipelago. Scientific Reports, 11(1), 1-14.
Rahmawati, N. D., dan Iftitah, S. N. 2024. The Effect Of Concentration And Soaking Length Of Aloe Vera Gel On The Growth Of Robusta Coffee (Coffea canephora) Cuttings. Agrisaintifika: Jurnal Ilmu-Ilmu Pertanian, 8(2), 286-291.
Sadikin dan Muhammad I. 2021. Optimasi Protokol Ekstraksi DNA Kelapa Sawit (Elaeis Guineensis Jacq.) pada Umur Tanaman yang Berbeda: Review." Agrista: Jurnal Ilmiah Mahasiswa Agribisnis UNS, 5(1): 1379-1389.
Saraswati H, Seprianto S, dan Wahyuni F D. 2019. Desain Primer Secara In Silico untuk Amplifikasi Gen cryIII dari Bacillus thuringiensis Isolat Lokal. Indonesian Journal of Biotechnology and Biodiversity,3(1), 33-38.
Sari, V. K., dan Restanto, D. P. 2022. Review Artikel: Metode Ekstraksi DNA Genom untuk Tanaman Tinggi Kandungan Polisakarida dan Metabolit Sekunder. Agroteknika, 5(2), 118-129
Sembiring, E. R., Terryana, R. T., Anggraheni, Y. G. D., Prihaningsih, A., Batubara, I., Nurcholis, W.,dan Harmoko, R. Efektivitas Metode Ekstraksi DNA pada Daun Segar dan Kering dari Tanaman Obat. Vegetalika, 12(3), 211-227.
Downloads
Published
2025-03-02
How to Cite
Lestari, S. W., Rustiati, E. L. ., Priyambodo, P., Wahyuningsih, S., Sandra, S., Winarno, W., … Permatasari, N. . (2025). AMPLIFIKASI GEN N-METHYLTRANSFERASE KOPI ROBUSTA DI PERKEBUNAN KOPI RAKYAT WIYONO LAMPUNG: AMPLIFIKASI GEN N-METHYLTRANSFERASE KOPI ROBUSTA DI PERKEBUNAN KOPI RAKYAT WIYONO LAMPUNG. Jurnal Biogenerasi, 10(2), 1027–1032. https://doi.org/10.30605/biogenerasi.v10i2.5544
Issue
Section
Articles
License
In submitting the manuscript to the journal, the authors certify that:
- They are authorized by their co-authors to enter into these arrangements.
- The work described has not been formally published before, except in the form of an abstract or as part of a published lecture, review, thesis, or overlay journal.
- That it is not under consideration for publication elsewhere,
- That its publication has been approved by all the author(s) and by the responsible authorities – tacitly or explicitly – of the institutes where the work has been carried out.
- They secure the right to reproduce any material that has already been published or copyrighted elsewhere.
- They agree to the following license and copyright agreement.
License and Copyright Agreement
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under Creative Commons Attribution License (CC BY 4.0) that allows others to share the work with an acknowledgment of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgment of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work.
.png)
